主要用于對特定 DNA 或 RNA 片段做精準定量的 PCR 定量試劑盒,是分子生物學實驗里不可缺少的工具,不管是基因表達分析、病原體檢測,還是環(huán)境樣本監(jiān)測,選合適的試劑盒能大幅提升實驗效率與數據可靠性,面對市面上種類五花八門的產品,好多實驗人員時常會感到困惑,本文會從幾個關鍵的角度,幫您迅速掌控 PCR 定量試劑盒的核心要點。
如何選擇合適的PCR定量試劑盒
先得將實驗的目的以及樣本類型給明確出來,如果是用來檢測低豐度靶標的話,那就得挑選高靈敏度的試劑盒,要是樣本當中存在著較多抑制劑的話,那就得留意試劑盒的抗抑制能力情況,就好比土壤或者血液樣本里面的腐殖酸、血紅素容易對PCR反應產生干擾那樣的狀況下,這個時候就應該去選用專門設計的抗抑制型試劑盒。
其次,要對試劑盒的檢測范圍展開考察,不同試劑盒,其線性動態(tài)范圍存在較大差異,好的產品能夠覆蓋6-8個數量級,建議去查閱產品說明書里的標準曲線參數,重點關注擴增效率是不是在90%-110%之間,R2值是否大于0.99,實際使用的時候,可以先做一個預實驗進行驗證。
PCR定量試劑盒靈敏度有多高
核心指標之一是評價試劑盒性能的靈敏度,目前主流產品檢測下限可以達到單拷貝級別,然而實際應用中受到樣本純度、引物設計等因素的影響,比如說在環(huán)境水樣里檢測痕量 DNA,需要試劑盒能夠穩(wěn)定檢出 10 個以下拷貝,選購的時候可以要求供應商提供靈敏度驗證數據。
值得留意的是,靈敏度可不是越高就越好。靈敏度過高的話,有可能產生假陽性的風險,特別是在借助染料法開展檢測之際。建議依據實驗的需求,使靈敏度和特異性達到平衡。對于常規(guī)的基因表達定量而言,100至200拷貝的檢測下限一般就足夠了。進行梯度稀釋實驗能夠更為客觀地評估實際的靈敏度。
定量PCR試劑盒操作有哪些關鍵點
配制反應體系是首要步驟,建議于冰面進行操作,以此來防止酶活性過早被激活。充分混勻所有組分,并且進行短暫離心,防止氣泡對熒光信號采集造成影響。運用帶濾芯的槍頭能夠有效降低氣溶膠污染,針對每個樣本,建議設置三個重復孔,用于評估技術誤差。
程序設置的循環(huán)這種操作是非常關鍵重要的,退火這一溫度是需要依據引物的Tm值來進行優(yōu)化的,一般情況下是要比Tm值低3到5℃,延伸的時間是要保證足夠但又不適合過長的,通常是按照每kb 30秒去計算這一數據的,熔解曲線的分析是用來驗證產物特異性的一個必備步驟,出現單峰就表明不存在非特異擴增,每一次的實驗都是要包含沒有模板的對照以及已知濃度的標準品的。
試劑盒保存與批次穩(wěn)定性
諸多PCR定量試劑盒需于-20℃環(huán)境下避光進行保存,反復凍融這種行為會致使酶活性以及熒光染料穩(wěn)定性有所降低,建議把試劑予以分裝使之成為單次使用量,取用之后需即刻放回到冰箱當中,運輸進程里要是使用干冰,收貨過后要對包裝是否完好實施檢查,試劑有無結塊或者顏色出現變化。
不同批次之間的穩(wěn)定性對跨實驗的數據可比性有著直接的影響,選擇經過批間差驗證的產品是非常重要的,一般情況下要求Ct值的變異系數小于5%,在購買之前能夠詢問供應商是否提供批次質檢報告,與此同時建立內部質控品,每一次實驗都要檢測同一份標準品,以此便于監(jiān)控長期穩(wěn)定性。
當您于進行PCR定量試劑盒選購這個方面的時候,最為重視的是哪些性能指標呢,歡迎在評論區(qū)域分享您所擁有的經驗以及建議。






